温州医科大学药学院创建于2001年，拥有药学一级学科博士后科研流动站、药学一级学科博士点、中韩合作办学药学专业博士项目、药学和中药学一级学科学术型硕士点、药学专业学位硕士点。设有药学、生物制药、临床药学和中药学4个本科专业（其中药学、生物制药和临床药学3个专业入选国家级一流专业建设点），药学（生物药学创新实验班）及1个四年制本科留学生药学专业，已形成本科、硕士、博士一体化药学人才培养体系。现有在校生2100余人。

学院现有教职工182人，拥有中国工程院院士1人、长江学者2人、国家杰出青年科学基金获得者1人、国家“万人计划”科技创新领军人才3人、国家百千万人才2人、国家有突出贡献中青年专家1人、国家“万人计划”青年尖拔人才1人、国家优秀青年基金获得者2人；全国第二批黄大年教师团队（药学教师团队）、国家“万人计划”教学名师1人、全国优秀教师1人、全国五一劳动奖章1人、教育部教学指导委员会委员4人。

药学学科始于1987年获批的药理学二级硕士点，经过30余年建设，先后入选浙江省重中之重一级学科、浙江省一流A类学科和浙江省重点建设大学优势特色学科，2020-2022年药学学科连续三年位列中国软科排名前10%，在教育部第五轮学科评估结果中取得优异成绩；药理学与毒理学进入ESI全球前1.1‰。

学院拥有细胞生长因子药物和蛋白制剂国家工程研究中心、大分子药物与规模化制备全国重点实验室和生物医药省部共建协同创新中心等3个国家级科研平台和浙江省生物技术制药重点实验室、生长因子药物开发浙江省工程实验室、浙江省生长因子联合国际科技合作基地等5个省级科研平台。近10年来，承担了包括国家重点研发计划、国家新药创制重大科技专项等国家级重大项目，已立项国家自然科学基金共200余项；以第一单位在Nature、Circulation、Cell Metabolism等知名期刊发表多篇论文；围绕生长因子研发获新药临床批件4个；获国家科技进步一等奖1项、国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖2项和省部级科技一等奖6项。

学院建有国家级精品课程2门、教育部来华留学生英语品牌课程1门、国家级虚拟仿真实验教学一流课程1门、全国药学专业学位研究生精品课程1门、全国药学专业学位研究生优秀教学案例1项、省级虚拟仿真实验教学一流课程5门；获教育部首批生物制药专业虚拟教研室，省级教学团队1个和省级一流课程24门 、省级课程思政示范基层教学组织1个和省级课程思政示范课程5门；省级优秀研究生课程2门、省级研究生优秀教学案例4项。拥有浙江省药学实验教学重点示范中心和浙江省分析测试实验教学示范中心；全国高校实践育人创新创业基地1个，省级生物医药产业学院1个，省级产教融合示范基地和实践基地6个，省部级产教融合项目11项。获省级教学成果奖特等奖1项、一等奖2项、二等奖1项。学生培养成效显著，创新能力大幅提高，获全国“互联网+”创新创业大赛9项（含金奖2项），全国“挑战杯”13项（含金奖1项）。

学院高度重视校企医相结合，以交叉博士点“细胞生长因子与疾病”与临床医学学科共建；与恒瑞、石药、科伦、海正等国内著名药企建立药物联合研发平台和产教融合基地；与杭州市、慈溪市共建生物医药研究院；与温州市政府共建“中国基因药谷”，打造国内一流、国际知名的特色蛋白药物研发与产业化基地。围绕基础研究、技术创新和蛋白药物研发，实现新药的临床转化。经过20余年的探索，学院形成了“产学研医”深度融合的“大药学”发展模式。

学院坚持立德树人，药学党支部获教育部第二批高校“双带头人”教师党支部书记工作室，药学院党委被评为浙江省首批高校党建工作标杆院系，生物制药党支部入选第二批浙江省高校“双创”培育创建单位。入选国家级思政精品项目1项。获浙江省工人先锋号。牵头发起“肤生工程”公益项目，获第七届“浙江慈善奖”。

全院师生秉持“奋发 传承 创新”的发展理念，为建设国内一流、国际领先、特色引领、协调发展的高水平药学院团结奋斗。（数据截至2023年4月）